黑腹果蝇基因组组蛋白修饰模式研究

【摘要】“组蛋白密码”假设的思想,是以组蛋白修饰的实验数据为基础,使用统计分析的研究方法,寻找组蛋白修饰在基因组上成簇出现、重复出现的情况,相互组合协同修饰的模式。我们以黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)为研究对象,使用CoSBI(coherentandshiftedbiclusteridentification)算法对处于胚胎期14到16小时的黑腹果蝇胚胎干细胞,在基因组及基因组功能区域的22种组蛋白修饰的分布情况进行CoSBI聚类分析。首先,在黑腹果蝇全基因组范围和RNA聚合酶Ⅱ结合区域进行组蛋白组合模式研究,以获得在以上范围内的组蛋白修饰组合模式分析结果,即“核心组蛋白修饰”。其次,对黑腹果蝇基因组绝缘子结合蛋白的结合区域进行聚类分析,获得在此区域的组蛋白组合模式。最后,将黑腹果蝇胚胎期14-16小时胚胎干细胞基因分为表达与不表达两类,并在两类基因所在区域进行组蛋白组合模式的分析。通过从以上三个方面对黑腹果蝇组蛋白修饰组合模式的分析,寻找在黑腹果蝇基因组上组蛋白修饰“协同”调控模式,发现了与基因组功能区域相关的一些“核心组蛋白修饰”,为进一步探索“组蛋白密码”与人类的疾病及相关基因功能表达奠定基础。
【作者】张砚；
【导师】张利绒；
【作者基本信息】内蒙古大学，生物物理学，2014，硕士
【关键词】组蛋白修饰；组蛋白密码；黑腹果蝇；聚类；

【参考文献】
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